Ichigo Momomiya, 12 ans, est une collégienne pas comme les autres : en effet, à la suite d'un étrange événement, ses gènes ont fusionné avec ceux du chat d'Iriomote, un animal en voie de disparition ! Après avoir retrouvé les autres personnes présentes lors de cet incident, les cinq justicières mew mew sont enfin réunies pour combattre les extraterrestres ! Elles ont désormais une mission : trouver du mew aqua, cette eau prodigieuse aux pouvoirs extraordinaires... Mais l'alien Quiche et sa bande ne cessent de leur mettre des bâtons dans les roues !. Pendant ce temps, Ichigo craint qu'Aoyama découvre sa véritable identité....