An X de l'ère Reiwa. Un terrible tsunami, provoqué par une avalanche sous-marine, ravage la côte Pacifique. Toutefois, ce n'est qu'un avant-goût des calamités à venir. La bataille qui se joue sur le Fugaku entre dans sa phase finale, Des torpilles lourdes sont lancées alors que Konoé, sa grand-mère et le petit Ren se trouvent toujours dans le canot de sauvetage.. Contraint de changer de tactique, Yamato riposte en ciblant directement le monstre. Par la suite, tous découvriront pourquoi le kaijû s'est montré aux îles Senkaku....